Paquet : covtobed (1.3.5+dfsg-2)

[ Paquet source : covtobed  ]

conversion de « track » de couverture d’un fichier BAM dans un fichier BED

Ce paquet lit un ou plusieurs fichiers d’alignements (triés selon le format BAM) et produit des fichiers au format BED avec la couverture. Il joint des bases consécutives avec la même couverture et il peut être utilisé pour imprimer un fichier BED avec les régions ayant un intervalle de couverture particulier.

Autres paquets associés à covtobed

• dep: bamtools

  boîte à outils de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  bibliothèque dynamique de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger covtobed

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
armel	42,8 ko	125,0 ko	[liste des fichiers]