Paquet : bwa (0.7.18-1)

[ Paquet source : bwa  ]

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Étiquettes: Biologie: Protéines, Domaine: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Interface utilisateur: Ligne de commande, interface::text-mode, role::program, But: Analyse, Comparaison

Autres paquets associés à bwa

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Bibliothèque de compression - binaires

• rec: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

• sug: samtools

  traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
armel	194,1 ko	438,0 ko	[liste des fichiers]