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Paquet : python3-cctbx (2024.8+ds2+~3.21.1+ds1-3)

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Ressources externes :

Paquets similaires :

boite à outils en Python pour la cristallographie

Il s’agit d’une boîte à outils logicielle pour la cristallographie qui fournit les modules suivants : 

   – annlib_adaptbx,
   – boost_adaptbx,
   – cbflib_adaptbx,
   – ccp4io_adaptbx :enveloppes pour la fonctionnalité Boost dans CCTBX ;
   – cctbx : bibliothèques pour les applications de cristallographie,
             utiles pour la cristallographie de petites molécules et
             macro-molécules ;
   – cma_es,
   – crys3d : modules d’affichage de molécules, de densité d’électrons,
             et de données de réseau réciproque ;
   – dxtbx : la boîte à outils d’image de diffraction pour la gestion de
             détecteur de rayons X de complexité arbitraire pour
             différents formats standard ;
   – fable : bibliothèque d’émulation Fortran pour porter Fortran77 vers C++ ;
   – gltbx : liaisons de Python pour OpenGL ;
   – iotbx : travailler avec les formats courants de fichier de
             cristallographie ;
   – libtbx : le système de construction commun à tous les autres modules.
             Cela inclut une très fine enveloppe autour de l’outil
             logiciel de construction SCons. Il fournit aussi des
             utilitaires et des cadriciels utiles pour simplifier le
             développement d’application, incluant des outils de
             régression de test, la parallélisation à travers des systèmes
             multiprocesseurs et grappes et une syntaxe de configuration
             modulaire appelée PHIL (Python Hierarchial Interface Language)
             utilisée pour tout le CCTBX ;
   – mmtbx : fonctionnalité spécifique à la cristallographie de
             macro-molécules. Cela comprend toute la machinerie nécessaire
             pour le réglage des contraintes de géométrie, la correction
             et la mise à l’échelle de milieu ambiant, l’analyse de
             données de diffraction macro-moléculaire, le calcul de
             coefficients de mappage pondérés et la plupart des méthodes
             mises en œuvre dans phenix.refine. La majorité de
             l’infrastructure pour le serveur de validation MolProbity
             (et équivalent Phenix) est aussi située ici ;
   – omptbx : interface OpenMP ;
   – rstbx : boîte à outils de réseau réciproque pour autoindexer la
             diffraction de petites molécules Bragg, les vecteurs de
             de réseau réciproque indiqués ;
   – scitbx : calculs généraux scientifiques, incluant une famille de
             types de tableau C++ de haut niveau, une bibliothèque de
             transformée de Fourier rapide et un portage en C++ du
             minimiseur populaire L-BFGS quasi-Newton ;
   – smtbx : cristallographie de petites molécules ;
   – spotfinder :
   – tbxx :
   – wxtbx : contrôles wxPython utilisés dans l’interface graphique Phenix
             et utilitaires divers.

Ce paquet fournit une collection sélective de modules python du projet cctbx.

Étiquettes: Domaine: Sciences physiques, Mis en œuvre en: Python, Rôle: role::program, science::calculation, Sciences: Dessin, science::visualisation, use::analysing, But: Calcul, Visualisation de données

Autres paquets associés à python3-cctbx

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Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 36 369,1 ko285 141,0 ko [liste des fichiers]