Paquet : megahit (1.2.9-5)

[ Paquet source : megahit  ]

ultra-fast and memory-efficient meta-genome assembler

Megahit is an ultra-fast and memory-efficient NGS assembler. It is optimized for metagenomes, but also works well on generic single genome assembly (small or mammalian size) and single-cell assembly.

The software was praised in a Briefings in Bioinformatics 5/2020 review (DOI: 10.1093/bib/bbaa085).

Autres paquets associés à megahit

• dep: bzip2

  compresseur de fichier par tri de blocs de grande qualité – utilitaires

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-all

  paquet dépendant de toutes les versions d'exécutables prises en charge par Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger megahit

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1 135,6 ko	8 071,0 ko	[liste des fichiers]