Paquet : macsyfinder (2.1.4-1)

[ Paquet source : macsyfinder  ]

detection of macromolecular systems in protein datasets

MacSyFinder is a program to model and detect macromolecular systems, genetic pathways... in protein datasets. In prokaryotes, these systems have often evolutionarily conserved properties: they are made of conserved components, and are encoded in compact loci (conserved genetic architecture). The user models these systems with MacSyFinder to reflect these conserved features, and to allow their efficient detection

This package presents the Open Source Java API to biological databases and a series of mostly sequence-based algorithms.

Autres paquets associés à macsyfinder

• dep: hmmer

  profilage de modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences

• dep: libjs-jquery (>= 3.6.0)

  JavaScript library for dynamic web applications

• dep: libjs-sphinxdoc (>= 7.4)

  prise en charge de JavaScript pour la documentation de Sphinx

• dep: libjs-underscore

  JavaScript's functional programming helper library

• dep: ncbi-blast+

  suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-certifi

  certificats racines pour la validation de certificats SSL et la vérification d’hôtes TLS – Python 3

• dep: python3-colorama

  Cross-platform colored terminal text in Python - Python 3.x

• dep: python3-colorlog

  mise en forme pour le module de journalisation de Python 3

• dep: python3-networkx

  tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)

• dep: python3-packaging

  core utilities for python3 packages

• dep: python3-pandas

  structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »

• dep: python3-yaml

  analyseur et générateur de code YAML pour Python3

• dep: sphinx-rtd-theme-common (>= 2.0.0+dfsg)

  sphinx theme from readthedocs.org (common files)

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	14 200,2 ko	37 593,0 ko	[liste des fichiers]