Paquet : python3-ngs (3.0.3+dfsg-9)

[ Paquet source : sra-sdk  ]

liaisons du langage de séquençage de nouvelle génération –⋅liaisons Python⋅3

NGS est une nouvelle interface dédiée pour accéder aux lectures, alignements et fichiers au format pileup produits par les séquençages de nouvelle génération (Next Generation Sequencing). L'API elle-même ne dépend pas de l'implémentation d'un dorsal particulier et prend en charge l'utilisation de plusieurs dorsaux simultanément. Elle fournit aussi une bibliothèque pour construire de nouveaux moteurs de dorsaux. Le moteur pour accéder aux données SRA est fournit par le dépôt jumeau ncbi-vdb.

Cette interface de programmation est actuellement exprimée en langages⋅C++, Java et Python. Cette conception rend possible le maintien d'un haut degré de similarité du code entre deux langages –⋅surtout entre⋅C++ et Java.

Ce paquet fournit les liaisons Python⋅3.

Autres paquets associés à python3-ngs

• dep: libncbi-ngs3 (<< 3.0.3+dfsg-9.1~)

  Next Generation Sequencing language Bindings (full runtime)

  dep: libncbi-ngs3 (>= 3.0.3+dfsg-9)

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	41,7 ko	213,0 ko	[liste des fichiers]