Paquet : mipe (1.1-9)

[ Paquet source : mipe  ]

Outil de sauvegarde de données dérivées de PCR

MIPE fournit un format standard pour échanger et/ou enregistrer toutes les informations associées aux expérimentations PCR en utilisant un fichier texte simple. Cela permet :

 - d'échanger des données PCR entre chercheurs/laboratoires ;
 - de fournir une traçabilité des données ;
 - d'éviter des problèmes lors de la soumission de données à dbSTS ou
    dbSNP ;
 - d'écrire des scripts standards d'extraction de données (par exemple une
    liste de « PCR primers », positions SNP ou haplotypes pour différents
    animaux).

Bien que cet outil puisse être utilisé pour enregistrer des données, son but principal est l'échange de données. Pour de plus grands dépôts de données, des bases de données relationnelles sont plus appropriées pour leur enregistrement. Le format MIPE pourrait alors être utilisé pour importer et/ou exporter vers ces bases de données.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, field::biology:molecular, implemented-in::perl, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: role::TODO, role::documentation, Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::organizing, works-with-format::xml, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à mipe

• dep: libxml-perl

  Perl modules for working with XML

• dep: libxml-twig-perl

  Perl module for processing huge XML documents in tree mode

• dep: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	61,3 ko	211,0 ko	[liste des fichiers]