Paquet : cwltool (3.1.20241112140730-1)

[ Paquet source : cwltool  ]

implémentation de la référence du langage Common Workflow

C'est l'implémentation de référence des standards de Common Workflow Language.

Les standards ouverts CWL servent à décrire des analyses de flux de travail et des outils afin de les rendre portables et déployabls sur une grande diversité d'environnements logiciels et matériels, des stations de travail aux clustrs en passant par le cloud et le calcul haute performance (HPC). CWL a été conçu pour satisfaire les besoins des scientifiques manipulant beaucoup de données comme la bioinformatique, l'imagerie médicaale, l'astronomie, la physique et la chimie.

L'implémentation de la référence CWL (cwltool) vise à être entièrement personnalisée et à offrir une validation exhaustive de fichiers CWL, mais aussi d'autres outils de travail avec des descriptions CWL.

Étiquettes: Administration système: Automatisation et ordonnancement, Virtualisation, Domaine: field::astronomy, field::biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:molecular, Biologie structurale, field::medicine, field::physics, Mis en œuvre en: Python, Interface utilisateur: interface::commandline, role::program, Sciences: Calcul, Champ d'application: Utilitaire, Class of system: system::cloud, system::laptop, Serveur, Virtual, But: use::analysing, use::filtering, Format pris en charge: Étiquette supplémentaire nécessaire, Fonctionne avec: works-with::semantic-data, works-with::software:package

Autres paquets associés à cwltool

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  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-arcp

  (Archive and Package) URI parser and generator

• dep: python3-argcomplete

  complètement (Tab) de bash/zsh pour argparse – Python 3

• dep: python3-coloredlogs

  sortie colorée de terminal pour le module de connexion de Python 3

• dep: python3-cwl-utils (>= 0.32)

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• dep: python3-mypy-extensions

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• dep: python3-prov

  W3C Provenance Data Model (Python 3)

• dep: python3-psutil

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• dep: python3-pydot

  interface Python pour dot de Graphviz

• dep: python3-pyparsing

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• dep: python3-ruamel.yaml

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• dep: python3-schema-salad (>= 8.4.20230808163024)

  Schema Annotations for Linked Avro Data (SALAD)

• dep: python3-setuptools

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• dep: python3-spython

  Command line Python tool for working with Singularity

• rec: nodejs

  E/S par événement pour le moteur JavaScript V8

• sug: cwltool-doc

  Common Workflow Language reference implementation -- docs

• sug: podman

  tool to manage containers and pods

  ou docker.io

  Linux container runtime

  ou singularity-container

  Paquet indisponible

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