Paquet source : snpeff (5.2.e+dfsg-1)
Liens pour snpeff
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Dépôt de source Debian (Git)
- Suivis des correctifs pour Debian
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Andreas Tille (Page QA)
- Pierre Gruet (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [pcingola.github.io]
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- libsnpeff-java
- genetic variant annotation and effect prediction toolbox - lib
- libsnpeff-java-doc
- Documentation for Snp Effect
- snpeff
- genetic variant annotation and effect prediction toolbox - tool
Autres paquets associés à snpeff
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- adep: debhelper-compat (= 13)
- Paquet indisponible
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- adep: javahelper
- scripts d'aide pour l'empaquetage de programmes Java
-
- adep: default-jdk
- kit de développement Java standard ou compatible
-
- adep: default-jdk-doc
- kit de développement Java standard ou compatible – documentation
-
- adep: maven-debian-helper
- Helper tools for building Debian packages with Maven
-
- adep: libmaven-assembly-plugin-java
- Maven Assembly Plugin
-
- adep: libtrove3-java
- high performance collections for java
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- adep: libhtsjdk-java
- Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats
-
- adep: libbiojava6-java
- Java API to biological data and applications (version 6)
-
- adep: junit5
- cadriciel de tests de régression pour Java
-
- adep: libcommons-codec-java
- encoder and decoders such as Base64 and hexadecimal codec
-
- adep: libcommons-io-java
- Common useful IO related classes
-
- adep: libcommons-cli-java
- Command line arguments and options parsing library
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- adep: libcommons-math3-java
- Java lightweight mathematics and statistics components
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- adep: libfreemarker-java
- template engine written in Java
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- adep: libjaxb-api-java
- Java Architecture for XML Binding API
-
- adep: libmaven-javadoc-plugin-java
- Maven Javadoc Plugin
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- adep: libbiojava6-java-doc
- [Biology] Documentation for BioJava 6
-
- adep: libtrove3-java-doc
- high performance collections for java
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- adep: libcharts4j-java
- free, lightweight charts and graphs Java API
-
- adep: libapfloat-java
- high performance arbitrary precision arithmetic library for Java
-
- adep: libdistlib-java
- Java library of statistical distribution functions
Download snpeff
Fichier | Taille (en ko) | Somme MD5 |
---|---|---|
snpeff_5.2.e+dfsg-1.dsc | 2,5 ko | 718f10a8ff149f7b5e003416c53429b5 |
snpeff_5.2.e+dfsg.orig.tar.xz | 151 278,1 ko | 5881f26c0692e8fd2b4acdc716f42355 |
snpeff_5.2.e+dfsg-1.debian.tar.xz | 13,9 ko | e4d6f7abf6f67562cc810f03a4ffce2d |
- Dépôt Debian des paquets source (VCS: Git)
- https://salsa.debian.org/med-team/snpeff.git
- Dépôt Debian des paquets source (interface web)
- https://salsa.debian.org/med-team/snpeff