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Paquet source : picard-tools (3.1.1+dfsg-1)

Liens pour picard-tools

Ressources Debian :

Responsables :

Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
Charles Plessy (Page QA)
Olivier Sallou (Page QA)
Vincent Danjean (Page QA)
Andreas Tille (Page QA)
Steffen Moeller (Page QA)
Pierre Gruet (Page QA)

Ressources externes :

Page d'accueil [broadinstitute.github.io]

Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :

libpicard-java: Java library to manipulate SAM and BAM files
libpicard-java-doc: Documentation for the java picard library
picard-tools: outils en ligne de commande pour manipuler les fichiers SAM et BAM

Autres paquets associés à picard-tools

build-depends

build-depends-indep

adep: default-jdk

kit de développement Java standard ou compatible
adep: debhelper-compat (= 13)

Paquet indisponible
adep: javahelper

scripts d'aide pour l'empaquetage de programmes Java
adep: gradle-debian-helper

Helper tools for building Debian packages with Gradle
adep: maven-repo-helper

Helper tools for including Maven metadata in Debian packages
adep: libguava-java

Suite of Google common libraries for Java
adep: libcommons-collections4-java

Apache Commons Collections - Extended Collections API for Java
adep: libcommons-io-java

Common useful IO related classes
adep: libcommons-lang-java

Commons Lang - an extension of the java.lang package
adep: libcommons-lang3-java

Apache Commons Lang utility classes
adep: libcommons-math3-java

Java lightweight mathematics and statistics components
adep: libbarclay-java

Java library to parse command line
adep: libgkl-java

Java library to manipulate SAM and BAM files
adep: libgkl-jni [amd64]

native libraries of Java library to manipulate SAM and BAM files
adep: libgatk-native-bindings-java

library of native bindings for gatk and picard-tools
adep: libhtsjdk-java (>= 3.0.2+dfsg)

Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats
adep: libjoptsimple-java

Command line parsing java library
adep: testng

Cadre applicatif de tests pour Java
adep: r-base-core

noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
adep: default-jdk-doc

kit de développement Java standard ou compatible – documentation
adep: libhtsjdk-java-doc

Documentation for the java HTSJDK library
adep: libjs-jquery

JavaScript library for dynamic web applications

Download picard-tools

Fichier	Taille (en ko)	Somme MD5
picard-tools_3.1.1+dfsg-1.dsc	2,7 ko	6f3bfd0a0f0eb740e24e53011b8d9e8d
picard-tools_3.1.1+dfsg.orig.tar.xz	19 941,3 ko	4c2ab8018a847e95b5495ed38a7d8109
picard-tools_3.1.1+dfsg-1.debian.tar.xz	22,2 ko	f7f70351901d0ef3ae7566d24b007db2

Dépôt Debian des paquets source (VCS: Git): https://salsa.debian.org/med-team/picard-tools.git
Dépôt Debian des paquets source (interface web): https://salsa.debian.org/med-team/picard-tools