Paquet source : bioperl-run (1.7.2-4)
Liens pour bioperl-run
Ressources Debian :
Responsables :
Ressources externes :
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- bioperl-run
- scripts d'enveloppe BioPerl
- libbio-perl-run-perl
- modules d'enveloppe BioPerl
Autres paquets associés à bioperl-run
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- adep:
debhelper
(>= 11~)
- programmes assistants pour debian/rules
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- idep:
perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
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- idep:
libmodule-build-perl
- framework for building and installing Perl modules
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- idep:
bioperl
- outils en Perl pour la bio-informatique
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- idep:
libalgorithm-diff-perl
- module pour trouver des différences entre des fichiers
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- idep:
libipc-run-perl
- module de Perl pour l’exécution de programme
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- idep:
libio-string-perl
- Emulate IO::File interface for in-core strings
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- idep:
libxml-twig-perl
- module Perl pour le traitement arborescent de très gros documents XML
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- idep:
libtest-most-perl
- Perl module with the most commonly needed test functions and features
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- idep:
libarray-compare-perl
- module Perl pour comparer facilement des tableaux
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- idep:
libtree-dagnode-perl
- Perl (super)class for representing nodes in a tree
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- idep:
amap-align
- alignement multiple de séquences protéiques par appariement
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- idep:
bedtools
- suite d'utilitaires pour la comparaison des caractéristiques de génomes
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- idep:
blast2
- paquet factice de transition vers ncbi-blast+-legacy
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- idep:
bowtie
- aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
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- idep:
bwa
- dispositif d'alignement Burrows-Wheeler
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- idep:
clustalw
- alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
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- idep:
emboss
- ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne
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- idep:
exonerate
- outil générique pour la comparaison de deux séquences
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- idep:
hmmer
- profilage de modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences
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- idep:
hyphy-mpi
- Hypothesis testing using Phylogenies (MPI version)
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- idep:
infernal
- inférence d’alignements structurels secondaires d’ARN
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- idep:
kalign
- Alignement séquentiel multiple global et progressif
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- idep:
maq
- correspondance de lectures de séquences d'ADN polymorphique de longueur courte à des séquences de référence
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- idep:
mafft
- programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés
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- idep:
muscle
- Programme d'alignements multiples de séquences de protéine
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- idep:
ncoils
- prédiction de structure secondaire de superhélice
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- idep:
phylip
- paquet de programmes pour déduire les phylogénies
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- idep:
phyml
- estimation phylogénétique utilisant la probabilité maximale
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- idep:
primer3
- outil de choix d'amorces l'amplification d'ADN
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- idep:
probcons
- alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste
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- idep:
raxml
- ressemblance maximale accélérée aléatoire d'arbres phylogénétiques
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- idep:
samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
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- idep:
sim4
- Outil d'alignement d'ADNc et d'ADN génomique
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- idep:
t-coffee
- alignement multiple de séquences
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- idep:
tigr-glimmer
- Détection de gènes dans des archées et des bactéries
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- idep:
wise
- comparaison de biopolymères, tels les séquences d'ADN et de protéines
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- idep:
libwww-perl
- interface simple et cohérente au world-wide web
