Paquet source : circlator (1.5.5-3)
Liens pour circlator
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Ressources externes :
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- circlator
- circularisation d'assemblages de génomes
Autres paquets associés à circlator
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- adep:
debhelper
(>= 12~)
- programmes assistants pour debian/rules
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- adep:
dh-python
- outils d’assistance pour Debian pour empaqueter les bibliothèques et applications Python
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- adep:
python3-all
- package depending on all supported Python 3 runtime versions
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- adep:
python3-setuptools
- Améliorations de Python3 Distutils
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- adep:
python3-openpyxl
- Python 3 module to read/write OpenXML xlsx/xlsm files
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- adep:
python3-jdcal
- Julian dates from proleptic Gregorian and Julian calendars
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- adep:
fastaq
(>= 3.12.1)
- outils de manipulation de fichiers FASTA ou FASTQ
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- adep:
python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
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- adep:
python3-pymummer
- Python 3 interface to MUMmer
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- adep:
python3-nose
- test discovery and running for Python3 unittest
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- adep:
spades
- assembleur génomique pour des ensembles de données de « single-cell » et « isolates »
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- adep:
bwa
(>= 0.7.12)
- dispositif d'alignement Burrows-Wheeler
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- adep:
prodigal
- Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
-
- adep:
canu
(<< 1.8+dfsg-1)
- assembleur de séquences de molécules simples pour les génomes
- ou
canu
(>= 1.8+dfsg-2)
- assembleur de séquences de molécules simples pour les génomes
