Paquet source : ariba (2.13.3+ds-1)
Liens pour ariba
Ressources Debian :
Responsables :
Ressources externes :
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- ariba
- identification de résistance antibiotique par assemblage
Autres paquets associés à ariba
-
- adep:
debhelper
(>= 11)
- programmes assistants pour debian/rules
-
- adep:
python3-biopython
- Python library for bioinformatics (implemented in Python 3)
-
- adep:
python3-dev
- fichiers d'en-tête et bibliothèque statique pour Python − par défaut
-
- adep:
python3-dendropy
- DendroPy Phylogenetic Computing Library (Python 3)
-
- adep:
python3-setuptools
- Améliorations de Python3 Distutils
-
- adep:
python3-pymummer
(>= 0.10.2)
- Python 3 interface to MUMmer
-
- adep:
python3-pysam
(>= 0.9.1)
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- adep:
python3-nose
(>= 1.3)
- test discovery and running for Python3 unittest
-
- adep:
python3-bs4
- error-tolerant HTML parser for Python 3
-
- adep:
python3-matplotlib
- système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab –⋅Python⋅3
-
- adep:
python3-tk
- Tkinter –⋅écriture d'applications Tk avec Python⋅3.x
-
- adep:
bowtie2
(>= 2.1.0)
- aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
-
- adep:
cd-hit
- suite de programmes conçus pour grouper rapidement des séquences
-
- adep:
mash
- estimation rapide de distance entre génomes et métagénomes utilisant MinHash
-
- adep:
libminimap-dev
- development headers for libminimap
-
- adep:
libfml-dev
(>= 0.1-4~)
- development headers for libfml
-
- adep:
mummer
- Alignement de séquence efficace de génomes complets
-
- adep:
fastaq
(>= 3.12.0)
- outils de manipulation de fichiers FASTA ou FASTQ
-
- adep:
help2man
- Générateur automatique de pages de manuel
-
- adep:
asciidoctor
- rendu AsciiDoc en HTML pour ruby
