Paquet : rasmol (2.7.6.0-3 et autres) [debports]

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visualisation de macromolécules biologiques

RasMol est un programme graphique moléculaire destiné à la visualisation de protéines, d'acides nucléiques et de petites molécules. Le programme est destiné à l'affichage, l'apprentissage et la génération d'images de la qualité des publications.

Le programme lit un fichier de coordonnées de molécule et l'affiche interactivement à l'écran avec diverses couleurs et représentations. Les molécules chargées peuvent être montrées comme des structures filaires, des liaisons cylindriques (drieding), des sphères remplissant l'espace (CPK), des rubans macromoléculaires, des boules avec des liaisons, des rubans de biomoléculaires solides et en brins, des étiquettes d'atomes et des surfaces de points.

Sont actuellement pris en charge les formats Brookhaven Protein Databank (PDB), Tripos' Alchemy et Sybyl Mol2, les formats de fichiers Molecular Design Limited's (MDL) Mol, le format Minnesota Supercomputer Center's (MSC) XMol XYZ et les formats de fichiers CHARMm, CIF et mmCIF.

Ce paquet installe deux versions de RasMol : rasmol-gtk possède une interface moderne en GTK et rasmol-classic est la version avec l'ancienne interface graphique Xlib.

Autres paquets associés à rasmol

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Bibliothèque graphique vectorielle Cairo 2D

• dep: libcbf1t64 (>= 0.9.5.18)

  bibliothèque partagée de prise en charge de CBFlib

• dep: libcneartree7t64 (>= 5.1.1)

  Library for solving the Nearest Neighbor Problem

• dep: libcqrlib2 (>= 1.1.2)

  Library for quaternion arithmetic and rotation math

• dep: libcvector2 (>= 1.0.3)

  ANSI C implementation of dynamic arrays

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0)

  bibliothèque GDK Pixbuf

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.38.0)

  bibliothèque GLib de routines C

• dep: libgtk-3-0t64 (>= 3.21.5)

  bibliothèque d'interface graphique utilisateur GTK

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Mise en place et rendu de texte internationalisé

• dep: libvte-2.91-0

  Terminal emulator widget for GTK 3 - runtime files

• dep: libx11-6

  bibliothèque X11 partie client

• dep: libxext6

  bibliothèque de diverses extensions pour X11

• rec: chemical-mime-data

  prise en charge de types MIME et de fichiers chimiques pour des bureaux

• sug: rasmol-doc

  documentation pour rasmol

Télécharger rasmol

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
x32 (portage non officiel)	2.7.6.0-3+b1	798,4 ko	3 957,0 ko	[liste des fichiers]