Paquet : nanolyse (1.2.0-4) [debports]

[ Paquet source :  ]

remove lambda phage reads from a fastq file

NanoLyse is a tool for rapid removal of contaminant DNA, using the Minimap2 aligner through the mappy Python binding. A typical application would be the removal of the lambda phage control DNA fragment supplied by ONT, for which the reference sequence is included in the package. However, this approach may lead to unwanted loss of reads from regions highly homologous to the lambda phage genome.

Autres paquets associés à nanolyse

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  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-biopython

  bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
x32 (portage non officiel)	24,7 ko	66,0 ko	[liste des fichiers]