Paquet : uc-echo (1.12-19 et autres)

[ Paquet source : uc-echo  ]

algorithme de correction d'erreurs pour les lectures courtes réalisées à partir de NGS

ECHO est un algorithme de correction d'erreurs conçu pour les lectures courtes réalisées à partir des plateformes de séquençage de nouvelle génération, telles que Genome Analyzer II de l'entreprise Illumina. L'algorithme utilise un modèle de Bayes pour améliorer la qualité des lectures dans un ensemble de données en utilisant autant que possible une estimation a posteriori.

Autres paquets associés à uc-echo

• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [ia64]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-scipy

  outils scientifiques pour Python 3

Télécharger uc-echo

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.12-19	71,1 ko	470,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.12-19	76,9 ko	361,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.12-19+b1	69,8 ko	470,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.12-19	69,0 ko	307,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.12-19	67,9 ko	239,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.12-19	78,4 ko	344,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.12-19	75,6 ko	339,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.12-18	88,5 ko	526,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.12-19	72,6 ko	319,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.12-19	73,2 ko	482,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.12-19	75,5 ko	533,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.12-19	75,7 ko	533,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.12-19	74,3 ko	277,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.12-19	76,5 ko	333,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.12-19	87,6 ko	464,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.12-19	67,4 ko	6 242,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.12-19	77,2 ko	331,0 ko	[liste des fichiers]