Paquet : subread (2.0.8+dfsg-1 et autres)

[ Paquet source : subread  ]

boite à outils pour le traitement de données de séquençage de nouvelle génération

L’aligneur Subread peut être utilisé pour les lectures de gDNA-seq et RNA-seq. L’aligneur Subjunc a été conçu particulièrement pour la détection de jonction exon-exon. Pour le mappage de lectures RNA-seq, Subread réalise des alignements locaux et Subjunc réalise des alignements globaux.

Autres paquets associés à subread

• dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, loong64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger subread

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.0.8+dfsg-1	778,7 ko	11 193,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.0.8+dfsg-1	792,3 ko	9 807,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.0.8+dfsg-1	742,7 ko	9 769,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.0.8+dfsg-1	615,9 ko	9 305,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.0.8+dfsg-1	612,7 ko	6 489,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.0.8+dfsg-1	847,2 ko	11 041,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.0.6+dfsg-3	876,9 ko	19 007,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	2.0.8+dfsg-1	796,0 ko	11 167,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.0.8+dfsg-1	783,5 ko	11 588,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.0.8+dfsg-1	832,2 ko	12 907,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.0.8+dfsg-1	844,8 ko	7 953,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.0.8+dfsg-1	720,5 ko	8 347,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.0.8+dfsg-1	776,4 ko	9 565,0 ko	[liste des fichiers]