Paquet : r-cran-tfmpvalue (0.0.9-1) [debports]

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GNU R P-Value Computation for Position Weight Matrices

In putative Transcription Factor Binding Sites (TFBSs) identification from sequence/alignments, it is interesting to obtain the significance of certain match score. TFMPvalue provides the accurate calculation of P-value with score threshold for Position Weight Matrices, or the score with given P-value. This package is an interface to code originally made available by Helene Touzet and Jean-Stephane Varre, 2007, Algorithms Mol Biol:2, 15.

Autres paquets associés à r-cran-tfmpvalue

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.2.2-1)

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.1)

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
sparc64 (portage non officiel)	47,7 ko	1 088,0 ko	[liste des fichiers]