Paquet : fastani (1.33-3 et autres) [debports]

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Fast alignment-free computation of whole-genome Average Nucleotide Identity

ANI is defined as mean nucleotide identity of orthologous gene pairs shared between two microbial genomes. FastANI supports pairwise comparison of both complete and draft genome assemblies.

Autres paquets associés à fastani

• dep: libc6 (>= 2.38)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.8)

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

• rec: r-cran-genoplotr

  Plot Publication-Grade Gene and Genome Maps

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
sparc64 (portage non officiel)	1.33-3+b1	88,2 ko	1 054,0 ko	[liste des fichiers]