Paquet : adapterremoval (2.3.3-3) [debports]

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découpe d'adaptateur rapide, identification et fusion de lectures de séquences de gènes

Ce programme recherche et supprime des vestiges de séquences d'adaptateur de données HTS (« High Throughput Sequencing ») et découpe (optionnellement) les bases de mauvaise qualité des extrémités 3' des lectures suivant la suppression de l'adaptateur. AdapterRemoval peut analyser à la fois des données « single end » et « paired end » et peut servir à fusionner des lectures « paired end » se chevauchant en des séquences de consensus (plus longues). De plus, AdapterRemoval peut servir à récupérer une séquence d'adaptateur de consensus pour les données « paired end » pour lesquelles cette information n'est pas disponible.

Autres paquets associés à adapterremoval

• dep: libbz2-1.0

  Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger adapterremoval

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
sparc64 (portage non officiel)	148,6 ko	1 066,0 ko	[liste des fichiers]