Paquet : soapdenovo (1.05-6)

[ Paquet source : soapdenovo  ]

méthode d'assemblage de lectures courtes pour construire une ébauche d’assemblage de novo

Le logiciel SOAPdenovo est une nouvelle méthode d'assemblage à lectures courtes qui peut construire une ébauche d’assemblage de novo pour les génomes de taille humaine. Le logiciel est spécialement conçu pour assembler les lectures courtes de la machine Genome Analyzer de l'entreprise Illumina.

Il crée de nouvelles opportunités pour la construction de séquences de référence et la réalisation d’analyses précises de génomes inexplorés de manière économique.

Cette version n’est plus entretenue, soapdenovo2 est à envisager.

Autres paquets associés à soapdenovo

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [ppc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

Télécharger soapdenovo

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	916,0 ko	1 496,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	955,7 ko	2 315,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	906,6 ko	1 723,0 ko	[liste des fichiers]