Paquet : simka (1.5.3-8 et autres)

[ Paquet source : simka  ]

comparative metagenomics method dedicated to NGS datasets

Simka is a de novo comparative metagenomics tool. Simka represents each dataset as a k-mer spectrum and compute several classical ecological distances between them.

Autres paquets associés à simka

• dep: libc6 (>= 2.34) [hppa, x32]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, hppa, ia64, loong64, x32]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2) [amd64]

  dynamic library of the Genome Analysis Toolbox

  dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg) [non amd64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, x32]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [non alpha, amd64, hppa, sparc64, x32]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libhdf5-103-1 [hppa, x32]

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libhdf5-103-1t64 [ia64]

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3) [non hppa, ia64, x32]

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 11) [hppa, x32]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [non hppa, ia64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger simka

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.5.3-8+b2	411,5 ko	2 860,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.5.3-8+b3	425,4 ko	2 581,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.5.3-8+b3	385,5 ko	2 529,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.5.3-6	436,2 ko	2 474,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.5.3-8+b1	423,0 ko	4 206,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.5.3-8+b2	403,3 ko	2 593,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.5.3-8+b2	358,5 ko	3 165,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.5.3-8+b2	411,5 ko	3 233,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.5.3-8+b2	417,9 ko	2 977,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.5.3-8+b3	422,1 ko	2 089,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.5.3-8+b2	358,2 ko	5 238,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.5.3-7	433,6 ko	2 351,0 ko	[liste des fichiers]