Paquet : r-bioc-hdf5array (1.30.1-1 et autres) [debports]

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HDF5 backend for DelayedArray objects

Implements the HDF5Array and TENxMatrix classes, 2 convenient and memory-efficient array-like containers for on-disk representation of HDF5 datasets. HDF5Array is for datasets that use the conventional (i.e. dense) HDF5 representation. TENxMatrix is for datasets that use the HDF5-based sparse matrix representation from 10x Genomics (e.g. the 1.3 Million Brain Cell Dataset). Both containers being DelayedArray extensions, they support all operations supported by DelayedArray objects. These operations can be either delayed or block-processed.

Autres paquets associés à r-bioc-hdf5array

• dep: libc6 (>= 2.37)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libhdf5-103-1t64

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libhdf5-hl-100t64

  HDF5 High Level runtime files - serial version

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18

  Paquet indisponible

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.31.5)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.27.2)

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-iranges

  conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers

• dep: r-bioc-rhdf5 (>= 2.31.6)

  BioConductor HDF5 interface to R

• dep: r-bioc-rhdf5filters

  GNU R HDF5 compression filters

• dep: r-bioc-rhdf5lib

  GNU R hdf5 library

• dep: r-bioc-s4arrays (>= 1.1.1)

  foundation of array-like containers in Bioconductor

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.13)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-cran-matrix

  paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses

• sug: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• sug: r-bioc-delayedmatrixstats

  fonctions pour les lignes et les colonnes des objets « DelayedMatrix »

• sug: r-bioc-experimenthub

  client BioConductor pour accéder aux ressources d’ExperimentHub

• sug: r-bioc-genefilter

  méthodes de filtrage de gènes à partir d’expériences sur puce

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-genomicranges

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• sug: r-bioc-singlecellexperiment

  S4 Classes for Single Cell Data

• sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.15.1)

  BioConductor assay container

• sug: r-cran-runit

  paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires

Télécharger r-bioc-hdf5array

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
sh4 (portage non officiel)	1.30.1-1+b1	8 565,0 ko	9 024,0 ko	[liste des fichiers]