Paquet : diamond-aligner (0.9.32-2) [debports]

[ Paquet source :  ]

aligneur de séquence locale accéléré compatible avec BLAST

DIAMOND est un aligneur de séquence pour les recherches et les séquences de protéines et d'ADN traduit conçu comme un remplacement direct des outils logiciels de NCBI BLAST. Il est utilisable pour les recherches protéine-protéine aussi bien que pour les recherches ADN-protéine portant sur des séquences courtes ou longues incluant des contigs et des assemblages, et fournit une accélération jusqu'à x 20,000 par rapport à BLAST.

Autres paquets associés à diamond-aligner

• dep: libc6 (>= 2.30)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 6)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

• rec: med-config (>= 2.1)

  paquet de configuration générale de Debian Med

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
sh4 (portage non officiel)	840,5 ko	1 786,0 ko	[liste des fichiers]