Paquet : sambamba (1.0.1+dfsg-2 et autres)

[ Paquet source : sambamba  ]

outils pour travailler avec des données SAM/BAM

Sambamba se positionne lui-même comme un remplaçant performant à samtools et fournit des outils pour :

 – un filtrage puissant avec sambamba view --filter ;
 – une fusion de type Picard d’en-têtes de SAM avec l’outil merge ;
 – des opérations facultatives pour les BAM en entier ;
 – une copie rapide d’une région dans un nouveau fichier avec l’outil slice ;
 – des copies de marquage ou suppression en utilisant le critère de Picard.

Autres paquets associés à sambamba

• dep: libc6 (>= 2.34) [non loong64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r127)

  bibliothèque de l'algorithme de compression Fast LZ –⋅exécutable

• dep: libphobos2-ldc-shared110 (>= 1:1.40.0)

  LLVM D Compiler - Standard and runtime libraries

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger sambamba

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.0.1+dfsg-2+b1	554,0 ko	2 409,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.0.1+dfsg-2+b1	489,2 ko	2 229,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.0.1+dfsg-2+b1	504,0 ko	2 547,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.0.1+dfsg-2+b1	583,7 ko	2 448,0 ko	[liste des fichiers]