Paquet : twopaco (1.0.0+dfsg-1)

[ Paquet source : twopaco  ]

construction des graphes de de Bruijn à partir de plusieurs génomes complets

TwoPaCo est une implémentation de l’algorithme décrit dans la publication « TwoPaCo : An efficient algorithm to build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes ».

Ce paquet fournit deux programmes :

 – twopaco : outil pour la construction directe de graphes compressés pour
             plusieurs génomes complets ;
 – graphdump : utilitaire transformant la sortie de twopaco en format
               textuel.

Autres paquets associés à twopaco

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libtbb12 (>= 2021.5.0)

  bibliothèque de parallélisme pour C++ – environnement d’exécution

• dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.5.0)

  parallelism helper library for C++ - runtime files

Télécharger twopaco

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
s390x	341,1 ko	1 644,0 ko	[liste des fichiers]