Paquet : r-bioc-dropletutils (1.26.0+ds-2)

[ Paquet source : r-bioc-dropletutils  ]

utilitaires de BioConductor pour gérer des données de gouttelette de cellule unique

Ce paquet fournit un certain nombre d’utilitaires pour gérer des données de séquençage de l’ARN de cellule unique à partir de technologies de gouttelette telles que celle de 10X Genomics. Cela inclut le chargement de données à partir de fichiers de matrice de comptage ou d’information de molécule, l’identification de cellules à partir de gouttelettes vides, la suppression de pseudo-cellules « barcode-swapped » et le filtrage de matrice de comptage.

Autres paquets associés à r-bioc-dropletutils

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3)

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libhdf5-cpp-310 (>= 1.14.3)

  HDF5 - C++ runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.20

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-beachmat

  E/S pour plusieurs formats de stockage de données de matrice

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.31.9)

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-delayedmatrixstats

  fonctions pour les lignes et les colonnes des objets « DelayedMatrix »

• dep: r-bioc-edger

  analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R

• dep: r-bioc-genomicranges

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-hdf5array

  HDF5 backend for DelayedArray objects

• dep: r-bioc-iranges

  conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers

• dep: r-bioc-rhdf5

  BioConductor HDF5 interface to R

• dep: r-bioc-rhdf5lib

  GNU R hdf5 library

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-scuttle

  BioConductor single-cell RNA-Seq analysis utilities

• dep: r-bioc-singlecellexperiment

  S4 Classes for Single Cell Data

• dep: r-bioc-sparsearray (>= 1.5.18)

  efficient in-memory representation of multidimensional sparse arrays

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• dep: r-cran-bh

  paquet (virtuel) de GNU R pour fournir BH

• dep: r-cran-dqrng

  GNU R fast pseudo random number generators

• dep: r-cran-matrix

  paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses

• dep: r-cran-r.utils

  GNU R various programming utilities

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-cran-jsonlite

  Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Télécharger r-bioc-dropletutils

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
s390x	401,3 ko	785,0 ko	[liste des fichiers]