Paquet : r-bioc-biovizbase (1.52.0-1)

[ Paquet source : r-bioc-biovizbase  ]

GNU R basic graphic utilities for visualization of genomic data

The biovizBase package is designed to provide a set of utilities, color schemes and conventions for genomic data. It serves as the base for various high-level packages for biological data visualization. This saves development effort and encourages consistency.

Autres paquets associés à r-bioc-biovizbase

• dep: libc6 (>= 2.2)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.66.0)

  GNU R Annotation Database Interface pour BioConductor

• dep: r-bioc-annotationfilter (>= 1.28.0)

  fonctions pour le filtrage des ressources d'annotation de BioConductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-ensembldb (>= 2.28.0)

  GNU R utilities to create and use an Ensembl based annotation database

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.40.0)

  BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

• dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.56.0)

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 2.20.0)

  importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)

  BioConductor assay container

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.50.0)

  BioConductor annotation of genetic variants

• dep: r-cran-dichromat

  schémas de couleurs de GNU R pour les dichromates

• dep: r-cran-hmisc

  fonctions diverses de GNU R créées par Franck Harell

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées

• dep: r-cran-rlang

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• dep: r-cran-scales

  Scale functions for visualization

• sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.72.0)

  infrastructure de BioConductor pour les paquets de données de génome basés sur Biostrings

• sug: r-bioc-rtracklayer (>= 1.64.0)

  GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks

• sug: r-cran-runit

  paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires

Télécharger r-bioc-biovizbase

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
s390x	2 592,0 ko	3 069,0 ko	[liste des fichiers]