Paquet : python3-cogent3 (2020.2.7a+dfsg-2 et autres) [debports]

[ Paquet source :  ]

framework pour la biologie du génome

PyCogent est une bibliothèque pour la biologie du génome. C'est un framework complètement intégré et testé en profondeur pour :

 - le pilotage d'applications tierces ;
 - la conception de workflows ; l'interrogation des bases de données ;
 - la conduite de nouvelles analyses probabilistes de l'évolution de
    séquences biologiques ;
 - la génération de publications avec des graphismes de qualité.

Il se distingue par de nombreuses fonctionnalités uniques intégrées (telles que l'alignement de codons véritables) et l'ajout fréquent de méthodes complètement nouvelles pour l'analyse de données de génomes.

Autres paquets associés à python3-cogent3

• dep: libc6 (>= 2.27)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.9)

  dep: python3 (>= 3.8~)

• dep: python3-matplotlib

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab

• dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

• dep: python3-pandas

  structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »

• dep: python3-plotly

  Python 3 plotting library for publication-quality graphs

• dep: python3-scitrack

  Python3 library to track scientific data

• dep: python3-tinydb

  document oriented database optimized

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: dialign

  alignement de plusieurs séquences par segments

• rec: ncbi-blast+-legacy

  script d’appel de legacy de BLAST du NCBI

• sug: python-cogent-doc

  docs for python3-cogent3

Télécharger python3-cogent3

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
riscv64 (portage non officiel)	2020.2.7a+dfsg-2+b1	1 485,7 ko	5 526,0 ko	[liste des fichiers]