Paquet : primer3 (2.6.1-4 et autres)

[ Paquet source : primer3  ]

outil de choix d'amorces l'amplification d'ADN

Primer3 choisit des amorces pour des réactions de polymérisation en chaîne, avec les critères suivants : la température de fusion des oligonucléotides, leur taille, leur contenu en GC et la possibilité de former des dimères ; la taille du produit de PCR ; les contraintes positionnelles dans la séquence source ; diverses autres contraintes. Tous ces critères peuvent êtres spécifiés comme des contraintes par l'utilisateur et certains sont spécifiables comme les termes d'une fonction objective qui caractérise une paire idéale d'amorces.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: scope::utility, works-with-format::plaintext, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à primer3

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• sug: ncbi-epcr

  outil pour vérifier la présence d'un marqueur dans une séquence d'ADN

• enh: emboss

  ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
riscv64	2.6.1-4+b1	196,0 ko	695,0 ko	[liste des fichiers]