[ Paquet source : mafft ]
Paquet : mafft (7.505-1 et autres)
Liens pour mafft
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source mafft :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Charles Plessy (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [mafft.cbrc.jp]
Paquets similaires :
programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés
MAFFT est un programme d'alignement multiple de séquences qui offre trois méthodes orientées précision : - L-INS-i : probablement la plus précise ; recommandée pour moins de
200 séquences ; méthode de raffinement itératif qui incorpore les informations d'alignement des paires locales ;- G-INS-i : convient pour des séquences de longueurs similaires ;
recommandée pour moins de 200 séquences ; méthode de raffinement itératif qui incorpore les informations d'alignement des paires globales ;- E-INS-i : convient pour des séquences qui contiennent de grandes régions
non-alignables ; recommandée pour moins de 200 séquences. MAFFT fournit également cinq méthodes orientées vitesse : - FFT-NS-i : méthode de raffinement itératif de deux cycles seulement ; - FFT-NS-i : méthode de raffinement itératif d'un maximum de 1 000itérations ;
- FFT-NS-2 : rapide, méthode progressive ; - FFT-NS-1 : très rapide, recommandé pour plus de 2 000 séquences ; méthode progressive avec un arbre de recherche grossier ; - NW-NS-PartTree-1 : recommandé pour environ 50 000 séquences ; méthode progressive avec l'algorithme PartTree.
Autres paquets associés à mafft
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
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- rec: blast2
- Paquet indisponible
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- rec: libwww-perl
- interface simple et cohérente au world-wide web
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- rec: lynx
- navigateur web non graphique (en mode texte)
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- rec: ruby
- interpréteur pour le langage de script orienté objet Ruby – version par défaut
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- enh: t-coffee
- alignement multiple de séquences
Télécharger mafft
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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riscv64 | 7.505-1+b1 | 1 085,5 ko | 9 760,0 ko | [liste des fichiers] |