Paquet : bwa (0.7.17-7 et autres)
Liens pour bwa
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source bwa :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Charles Plessy (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
- Carlos Borroto (Page QA)
- Ognyan Kulev (Page QA)
- Michael R. Crusoe (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [bio-bwa.sourceforge.net]
Paquets similaires :
dispositif d'alignement Burrows-Wheeler
BWA est un paquet logiciel pour mettre en correspondance des séquences à faible divergence avec un grand génome de référence tel que le génome humain. Il est constitué de trois algorithmes : BWA-backtrack, BWA-SW et BWA-MEM. Le premier algorithme est conçu pour les lectures de séquences Illumina jusqu'à 100 paires de bases, alors que les deux autres sont conçus pour des lectures de séquences allant de 70 à 1 000 paires de bases. BWA-MEM et BWA-SW partagent des fonctionnalités communes telles que la prise en charge des lectures longues et des alignements de découpages (« split alignment »), mais BWA-MEM, plus récent, est généralement recommandé pour les requêtes de haute qualité, car il est plus rapide et plus précis. BWA-MEM a également de meilleures performances que BWA-backtrack pour les lectures Illumina de 70 à 100 paires de bases.
Autres paquets associés à bwa
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
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- rec: perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
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- sug: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
Télécharger bwa
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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riscv64 | 0.7.17-7+b4 | 212,8 ko | 372,0 ko | [liste des fichiers] |