Paquet : ray (2.3.1-9 et autres)

[ Paquet source : ray  ]

de novo genome assemblies of next-gen sequencing data

Ray is a parallel software that computes de novo genome assemblies with next-generation sequencing data. Ray is written in C++ and can run in parallel on numerous interconnected computers using the message-passing interface (MPI) standard. Included:

 - Ray de novo assembly of single genomes
 - Ray Méta de novo assembly of metagenomes
 - Ray Communities microbe abundance + taxonomic profiling
 - Ray Ontologies gene ontology profiling

Autres paquets associés à ray

• dep: libbz2-1.0

  Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)

• dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, loong64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, loong64, ppc64el, s390x, x32]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 4.2.1) [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [non armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4, x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: mpi-default-bin

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [non armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Bibliothèque de compression - binaires

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Télécharger ray

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.3.1-9	797,4 ko	2 741,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.3.1-9	863,9 ko	2 449,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.3.1-9	789,2 ko	2 353,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.3.1-9	746,9 ko	2 136,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.3.1-9	768,8 ko	1 672,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2.3.1-9	827,4 ko	2 344,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.3.1-9	927,6 ko	2 660,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.3.1-8+b1	952,8 ko	4 388,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	2.3.1-9	819,2 ko	2 353,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.3.1-9	830,0 ko	2 424,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.3.1-9	813,3 ko	3 023,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.3.1-9	851,5 ko	3 121,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.3.1-9	853,1 ko	2 801,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.3.1-9	851,9 ko	1 941,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.3.1-9	848,5 ko	2 481,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.3.1-9	987,1 ko	2 353,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.3.1-9	727,3 ko	2 549,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.3.1-8+b2	844,0 ko	2 301,0 ko	[liste des fichiers]