Paquet : r-cran-tcr (2.3.2+ds-1 et autres)

[ Paquet source : r-cran-tcr  ]

Advanced Data Analysis of Immune Receptor Repertoires

Cells of the immune system are the grand exception to the rule that all cells of an individuum have (mostly exact) copies of the same DNA. B cells (which produce antibodies) and T cells (which communicate with cells) however have a section of their DNA with genes of the groups V, D and J that are reorganised within the genomic DNA to provide the flexibility to deal with yet unknown pathogens.

This package provides a platform for the advanced analysis of T cell receptor repertoire data and its visualisations.

Caveat: This package is soon to be replaced by http://github.com/immunomind/immunarch which is not yet available as a Debian package.

Autres paquets associés à r-cran-tcr

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [sh4]

  Paquet indisponible

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Paquet indisponible

• dep: libstdc++6 (>= 11) [loong64]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, hppa]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [non arm64, hppa, loong64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: r-api-3.5 [m68k, sh4]

  Paquet indisponible

• dep: r-api-4.0 [non m68k, sh4]

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-base-core (>= 3.6.1-2) [m68k, sh4]

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

  dep: r-base-core (>= 4.0.1-1) [non arm64, hppa, loong64, m68k, riscv64, sh4]

• dep: r-cran-data.table (>= 1.9.0)

  GNU R extension of Data.frame

• dep: r-cran-dplyr (>= 0.4.0)

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-ggplot2 (>= 1.0.0)

  implementation of the Grammar of Graphics

• dep: r-cran-gridextra (>= 0.9.0)

  GNU R package with extensions for the grid package

• dep: r-cran-gtable (>= 0.1.2)

  Arrange grobs in tables

• dep: r-cran-igraph (>= 0.7.1)

  analyse et visualisation de réseau avec GNU R

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.1)

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-reshape2 (>= 1.2.0)

  Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

• dep: r-cran-scales (>= 0.3.0)

  Scale functions for visualization

• dep: r-cran-stringdist (>= 0.7.3)

  GNU R approximate string matching and string distance functions

• sug: r-cran-knitr (>= 1.8)

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown (>= 1.0)

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-roxygen2 (>= 3.0.0) [non armel]

  in-line documentation for GNU R

Télécharger r-cran-tcr

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.3.2+ds-1	1 912,8 ko	2 126,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.3.2+ds-1	1 913,1 ko	2 114,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.3.2+ds-1+b1	1 918,5 ko	2 159,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.3.2+ds-1	1 909,1 ko	2 101,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.3.2+ds-1	1 909,2 ko	2 081,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2.3.2+ds-1+b1	1 921,9 ko	2 127,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.3.2+ds-1	1 913,6 ko	2 113,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.3.2+ds-1	1 920,2 ko	2 185,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	2.3.2+ds-1	1 912,5 ko	2 118,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.2.4-1	3 881,0 ko	6 068,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.3.2+ds-1	1 910,1 ko	2 127,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.3.2+ds-1	1 914,2 ko	2 152,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.3.2+ds-1	1 912,8 ko	2 150,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.3.2+ds-1+b1	1 916,4 ko	2 103,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.3.2+ds-1	1 911,4 ko	2 118,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.2.4-1	3 885,0 ko	6 068,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.3.2+ds-1	1 907,6 ko	2 114,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.3.2+ds-1	1 915,0 ko	2 109,0 ko	[liste des fichiers]