Paquet : r-cran-phangorn (2.12.1+dfsg-1 et autres)

[ Paquet source : r-cran-phangorn  ]

GNU R package for phylogenetic analysis

phangorn is a tool for reconstructing phylogenies, using distance-based methods, maximum parsimony or maximum likelihood, and performing Hadamard conjugation. It also offers functions for comparing trees, phylogenetic models or splits, simulating character data and performing congruence analysis.

Autres paquets associés à r-cran-phangorn

• dep: libblas3

  implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

  ou libblas.so.3

  paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [non alpha, ia64, loong64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, loong64, ppc64el, s390x]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, i386, mips64el, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [ia64]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [non ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2) [ia64]

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-cran-ape (>= 5.6) [ia64]

  paquet de GNU R pour l’analyse de phylogénie et d’évolution

  dep: r-cran-ape (>= 5.8) [non ia64]

• dep: r-cran-digest

  GNU R package for 'hash digest' of R data structures

• dep: r-cran-fastmatch

  GNU R package for fast match replacement for repeated look-ups

• dep: r-cran-generics

  GNU R common S3 generics not provided by base R methods

• dep: r-cran-igraph (>= 1.0)

  analyse et visualisation de réseau avec GNU R

• dep: r-cran-matrix

  paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses

• dep: r-cran-quadprog

  paquet de GNU R pour les problèmes d’optimisation quadratique

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• rec: r-bioc-biostrings [non armel, armhf, i386, ia64]

  GNU R string objects representing biological sequences

• rec: r-cran-ggplot2 [non ia64]

  implementation of the Grammar of Graphics

• rec: r-cran-ggseqlogo [non ia64]

  GNU R ggplot2 extension for publication-ready sequence logos

• rec: r-cran-knitr [non ia64]

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• rec: r-cran-magick [non ia64]

  advanced graphics and image-processing in GNU R

• rec: r-cran-rgl [non ia64]

  paquet de GNU R pour la visualisation en trois dimensions avec OpenGL

• rec: r-cran-rmarkdown [non ia64]

  convert R markdown documents into a variety of formats

• rec: r-cran-seqinr [non ia64]

  GNU R biological sequences retrieval and analysis

• rec: r-cran-testthat (>= 3.0.0) [non ia64]

  GNU R testsuite

• rec: r-cran-tinytest

  Lightweight and Feature Complete Unit Testing Framework

• rec: r-cran-vdiffr [non ia64]

  GNU R visual regression testing and graphical diffing

• rec: r-cran-xtable [non ia64]

  GNU R coerce data to LaTeX and HTML tables

• sug: r-bioc-biostrings

  GNU R string objects representing biological sequences

• sug: r-bioc-seqlogo

  GNU R sequence logos for DNA sequence alignments

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-magick

  advanced graphics and image-processing in GNU R

• sug: r-cran-rgl

  paquet de GNU R pour la visualisation en trois dimensions avec OpenGL

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-seqinr

  GNU R biological sequences retrieval and analysis

• sug: r-cran-xtable

  GNU R coerce data to LaTeX and HTML tables

Télécharger r-cran-phangorn

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.12.1+dfsg-1	1 763,2 ko	3 164,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.12.1+dfsg-1	1 776,7 ko	3 076,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.12.1+dfsg-1	1 756,3 ko	3 100,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.12.1+dfsg-1	1 753,6 ko	3 035,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.12.1+dfsg-1	1 756,1 ko	2 971,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2.12.1+dfsg-1+b1	1 772,7 ko	3 111,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.12.1+dfsg-1	1 785,3 ko	3 086,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.11.1+dfsg-1	1 664,2 ko	3 194,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	2.12.1+dfsg-1	1 765,4 ko	3 099,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.12.1+dfsg-1	1 753,5 ko	3 011,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.12.1+dfsg-1	1 755,8 ko	3 188,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.12.1+dfsg-1	1 782,1 ko	3 234,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.12.1+dfsg-1	1 781,4 ko	3 164,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.12.1+dfsg-1	1 774,9 ko	2 988,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.12.1+dfsg-1	1 782,5 ko	3 116,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.12.1+dfsg-1	1 791,9 ko	3 098,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.12.1+dfsg-1	1 744,5 ko	3 686,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.12.1+dfsg-1	1 775,5 ko	3 047,0 ko	[liste des fichiers]