Paquet : r-bioc-metapod (1.14.0+dfsg-2 et autres)

[ Paquet source : r-bioc-metapod  ]

méta-analyse avec GNU R de valeurs-p d’analyses différentielles

Ce paquet met en œuvre diverses méthodes pour combiner les valeurs-p dans des analyses différentielles d’ensembles de données à l’échelle du génome. Les fonctions peuvent combiner des valeurs-p à travers différents tests dans la même analyse (par exemple, des fenêtres génomiques dans des ChIP-seq, des exons dans le séquençage de l’ARN) ou pour des correspondances de tests à travers des analyses différentes (par exemple, des comparaisons répétées, des effets de conditions de traitement différentes). Une prise en charge est fournie pour la gestion de valeurs-p d’entrée transformées en log, les valeurs manquantes et la pondération lorsque c’est approprié.

Autres paquets associés à r-bioc-metapod

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [non alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  Paquet indisponible

• dep: r-api-bioc-3.20 [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-cran-rcpp (>= 1.0.7)

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Télécharger r-bioc-metapod

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.14.0+dfsg-2	208,2 ko	559,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.14.0+dfsg-2	219,8 ko	482,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.14.0+dfsg-2	200,6 ko	494,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.10.1+dfsg-1	197,7 ko	463,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.10.1+dfsg-1	210,1 ko	686,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.10.1+dfsg-1	190,0 ko	408,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.14.0+dfsg-2	197,5 ko	507,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.14.0+dfsg-2	212,1 ko	561,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.14.0+dfsg-2	212,4 ko	558,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.14.0+dfsg-2	218,9 ko	398,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.14.0+dfsg-2	217,3 ko	482,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.10.1+dfsg-1	210,7 ko	423,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.14.0+dfsg-2	193,8 ko	1 203,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.10.1+dfsg-1	200,8 ko	412,0 ko	[liste des fichiers]