Paquet : python3-vcf (0.6.8+git20170215.476169c-10 et autres)

[ Paquet source : python-pyvcf  ]

Variant Call Format (VCF) parser for Python 3

The Variant Call Format (VCF) specifies the format of a text file used in bioinformatics for storing gene sequence variations. The format has been developed with the advent of large-scale genotyping and DNA sequencing projects, such as the 1000 Genomes Project.

The intent of this module is to mimic the ``csv`` module in the Python stdlib, as opposed to more flexible serialization formats like JSON or YAML. ``vcf`` will attempt to parse the content of each record based on the data types specified in the meta-information lines -- specifically the ##INFO and ##FORMAT lines. If these lines are missing or incomplete, it will check against the reserved types mentioned in the spec. Failing that, it will just return strings.

This package provides the Python 3 modules.

Autres paquets associés à python3-vcf

• dep: libc6 (>= 2.17)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-pkg-resources

  découverte de paquets et accès aux ressources avec pkg_resources

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

Télécharger python3-vcf

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ppc64el	0.6.8+git20170215.476169c-10+b1	50,9 ko	229,0 ko	[liste des fichiers]