Paquet : snap-aligner (2.0.3+dfsg-2)

[ Paquet source : snap-aligner  ]

Scalable Nucleotide Alignment Program

SNAP is a new sequence aligner that is 3-20x faster and just as accurate as existing tools like BWA-mem, Bowtie2 and Novoalign. It runs on commodity x86 processors, and supports a rich error model that lets it cheaply match reads with more differences from the reference than other tools. This gives SNAP up to 2x lower error rates than existing tools (in some cases) and lets it match larger mutations that they may miss. SNAP also natively reads BAM, FASTQ, or gzipped FASTQ, and natively writes SAM or BAM, with built-in sorting, duplicate marking, and BAM indexing.

Autres paquets associés à snap-aligner

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger snap-aligner

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
mips64el	812,7 ko	2 544,0 ko	[liste des fichiers]