Paquet : r-cran-adegenet (2.1.10-1)

[ Paquet source : r-cran-adegenet  ]

GNU R exploratory analysis of genetic and genomic data

Toolset for the exploration of genetic and genomic data. Adegenet provides formal (S4) classes for storing and handling various genetic data, including genetic markers with varying ploidy and hierarchical population structure ('genind' class), alleles counts by populations ('genpop'), and genome-wide SNP data ('genlight'). It also implements original multivariate methods (DAPC, sPCA), graphics, statistical tests, simulation tools, distance and similarity measures, and several spatial methods. A range of both empirical and simulated datasets is also provided to illustrate various methods.

Autres paquets associés à r-cran-adegenet

• dep: libc6 (>= 2.4)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2)

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-cran-ade4

  GNU R analysis of ecological data

• dep: r-cran-ape

  paquet de GNU R pour l’analyse de phylogénie et d’évolution

• dep: r-cran-boot

  paquet de GNU R pour des fonctions de « bootstrapping » de Davison et Hinkley

• dep: r-cran-dplyr (>= 0.4.1)

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-ggplot2

  implementation of the Grammar of Graphics

• dep: r-cran-igraph

  analyse et visualisation de réseau avec GNU R

• dep: r-cran-mass

  paquet GNU R pour MASS de Venables et Ripley

• dep: r-cran-reshape2

  Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

• dep: r-cran-seqinr

  GNU R biological sequences retrieval and analysis

• dep: r-cran-shiny

  GNU R web application framework

• dep: r-cran-vegan

  Community Ecology Package for R

• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

• sug: r-cran-interp

  méthodes d’interpolation de GNU R

• sug: r-cran-maps

  aide de GNU R pour fabriquer des cartes géographiques

• sug: r-cran-spdep

  GNU R spatial dependence: weighting schemes, statistics and models

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
mips64el	2 655,9 ko	4 843,0 ko	[liste des fichiers]