Paquet : lamassemble (1.7.2-2)

[ Paquet source : lamassemble  ]

fusion de lectures « longues » d’ADN chevauchantes en séquences consensus

lamassemble fusionne des lectures « longues » d’ADN qui se chevauchent dans des séquences consensus (c’est-à-dire, les assemble). Il fonctionne bien quand le nombre de lectures est inférieur à approximativement un millier. L’assemblage n’est pas toujours précis. En particulier si les lectures proviennent d’énormes répétitions en tandem, de mauvaises parties des lectures pourraient être fusionnées.

Autres paquets associés à lamassemble

• dep: last-align

  comparaison de séquences biologiques à l'échelle du génome

• dep: mafft

  programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	131,6 ko	1 110,0 ko	[liste des fichiers]