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Paquet : igv (2.18.5+dfsg-1)

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visualiseur génomique intégratif

IGV (Integrative Genomics Viewer) est un afficheur très performant qui gère de grands ensembles de données hétérogènes, tout en fournissant une utilisation intuitive et sans problèmes à tous les niveaux de la résolution de génomes. Une caractéristique clé est sa préoccupation de la nature intégrative des études génomiques avec une prise en charge des données de séquençage basées sur les tableaux et de nouvelle génération, et l’intégration de données cliniques et de phénotypes. Bien que IGV soit souvent utilisé pour visualiser des données génomiques issues de données publiques, sa première utilité est d’aider les chercheurs voulant visualiser et explorer leurs propres données et celle de leurs collègues. Dans ce but, IGV gère de manière flexible des jeux de données locaux ou distants et il est optimisé pour offrir une visualisation et une exploration de hautes performance sur les systèmes de bureau standard.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::java, interface::commandline, Interface utilisateur: Graphical User Interface, interface::x11, network::client, Protocole réseau: HTTP, Rôle: Programme, Champ d'application: scope::utility, use::viewing, Fonctionne avec: Séquence biologique, Système X Window: Application

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