Paquet : gatb-core (1.4.2+dfsg-13 et autres)
Liens pour gatb-core
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source gatb-core :
- [gatb-core_1.4.2+dfsg-13.dsc]
- [gatb-core_1.4.2+dfsg.orig.tar.xz]
- [gatb-core_1.4.2+dfsg-13.debian.tar.xz]
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Nadiya Sitdykova (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
boite à outils génomique avec le graphe de de Bruijn
Le projet GATB-CORE fournit un ensemble d’algorithmes très efficaces pour analyser des ensembles de données de NGS. Ces méthodes permettent l’analyse d’ensembles de données de toutes tailles sur des ordinateurs de bureau multicœurs, y compris de quantités très importantes de données de lecture provenant de n’importe quel organisme tel qu’une bactérie, une plante, un animal ou même un échantillon plus complexe (par exemple, un métagénome). Plus d’informations sur GATB sont disponibles sur https://gatb.inria.fr/. En lui-même, GATB-CORE n’est pas un outil d’analyse NGS. Cependant, il peut être utilisé pour créer un tel outil. Il existe déjà un ensemble d’outils prêts à l’emploi basés sur la bibliothèque GATB-CORE : consulter https://gatb.inria.fr/software/.
Autres paquets associés à gatb-core
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libcppunit-1.15-0 (>= 1.15.1)
- Bibliothèque de test unitaire pour C++
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libhdf5-103-1t64
- HDF5 C runtime files - serial version
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- Bibliothèque de compression - binaires
Télécharger gatb-core
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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mips64el | 1.4.2+dfsg-13+b1 | 2 388,6 ko | 26 545,0 ko | [liste des fichiers] |