Paquet : busco (5.5.0-3) [debports]

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benchmarking sets of universal single-copy orthologs

Assessing genome assembly and annotation completeness with Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO).

 * Automated selection of lineages issued from https://www.orthodb.org/
 * Automated download of all necessary files and datasets to conduct a run
 * Use prodigal for non-eukaryotic genomes

Autres paquets associés à busco

• dep: bbmap

  BBTools genomic aligner and other tools for short sequences

• dep: hmmer

  profilage de modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences

• dep: prodigal

  Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-biopython

  bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique

• dep: python3-pandas

  structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »

Télécharger busco

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
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