Paquet : libngs-java (3.0.9+dfsg-7 et autres)

[ Paquet source : sra-sdk  ]

liaisons du langage de séquençage de nouvelle génération –⋅liaisons Java

NGS est une nouvelle interface dédiée pour accéder aux lectures, alignements et fichiers au format pileup produits par les séquençages de nouvelle génération (Next Generation Sequencing). L'API elle-même ne dépend pas de l'implémentation d'un dorsal particulier et prend en charge l'utilisation de plusieurs dorsaux simultanément. Elle fournit aussi une bibliothèque pour construire de nouveaux moteurs de dorsaux. Le moteur pour accéder aux données SRA est fournit par le dépôt jumeau ncbi-vdb.

Cette interface de programmation est actuellement exprimée en langages⋅C++, Java et Python. Cette conception rend possible le maintien d'un haut degré de similarité du code entre deux langages –⋅surtout entre⋅C++ et Java.

Ce paquet fournit les liaisons Java.

Autres paquets associés à libngs-java

• dep: libngs-jni (<< 3.0.9+dfsg-7.1~)

  Next Generation Sequencing language Bindings (Java native binding)

  dep: libngs-jni (>= 3.0.9+dfsg-7)

• sug: libngs-java-doc

  Next Generation Sequencing language Bindings (Java documentation)

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	3.0.9+dfsg-7+b1	109,4 ko	263,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	3.0.9+dfsg-7+b1	109,4 ko	263,0 ko	[liste des fichiers]