Paquet : libedlib-dev (1.2.7-6 et autres)

[ Paquet source : libedlib  ]

library for sequence alignment using edit distance (devel)

A lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance.

Calculating edit distance of two strings is as simple as:

 edlibAlign("hello", 5, "world!", 6,
            edlibDefaultAlignConfig()).editDistance;

Features

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

This package contains the static library and the header files.

Étiquettes: Développement de logiciel: Bibliothèques, Rôle: Bibliothèque de programmation

Autres paquets associés à libedlib-dev

• dep: libedlib1 (= 1.2.7-5) [ia64]

  library for sequence alignment using edit distance

  dep: libedlib1 (= 1.2.7-5+b1) [x32]

  dep: libedlib1 (= 1.2.7-6+b3) [non ia64, x32]

Télécharger libedlib-dev

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	22,4 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.2.7-6+b3	22,7 ko	74,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.2.7-6+b3	22,2 ko	73,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.2.7-6+b3	19,9 ko	65,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.2.7-6+b3	20,2 ko	60,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	21,8 ko	66,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.2.7-6+b3	22,3 ko	70,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.2.7-5	24,5 ko	91,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	48,4 ko	415,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	21,5 ko	71,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.2.7-6+b3	21,9 ko	76,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	22,4 ko	73,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.2.7-6+b3	24,9 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.2.7-6+b3	38,2 ko	277,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.2.7-6+b3	24,0 ko	78,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	23,8 ko	64,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	19,8 ko	68,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.2.7-5+b1	22,2 ko	70,0 ko	[liste des fichiers]