Paquet : metaeuk (6-a5d39d9+ds-5) [debports]

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sensitive, high-throughput gene discovery and annotation for metagenomics

MetaEuk is a modular toolkit designed for large-scale gene discovery and annotation in eukaryotic metagenomic contigs. MetaEuk combines the fast and sensitive homology search capabilities of MMseqs2 with a dynamic programming procedure to recover optimal exons sets. It reduces redundancies in multiple discoveries of the same gene and resolves conflicting gene predictions on the same strand.

Autres paquets associés à metaeuk

• dep: libatomic1 (>= 4.8)

  bibliothèque de prise en charge fournissant des fonctions internes __atomic

• dep: libbz2-1.0

  Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libunwind8

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ia64 (portage non officiel)	4 531,1 ko	19 960,0 ko	[liste des fichiers]