Paquet : delly (1.1.8-1 et autres) [debports]

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découverte de variantes structurelles par analyse des lectures

Delly est une méthode de prédiction de variantes structurelles (SV) intégrée qui peut découvrir, génotyper et visualiser des délétions, des duplications en tandem, des inversions et des translocations à une résolution mononucléotidique dans des données de séquençage massivement parallèles à lecture courte et longue. Il utilise des extrémités appariées, des lectures fractionnées et une profondeur de lecture pour délimiter avec sensibilité et précision les réarrangements génomiques dans tout le génome.

Autres paquets associés à delly

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  opérations sur le système de fichiers (chemins portables, itération sur des répertoires,⋅etc.) en C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  bibliothèque Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  bibliothèque d'options de programmes pour C++

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libunwind8

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ia64 (portage non officiel)	1.1.8-1+b2	506,4 ko	2 499,0 ko	[liste des fichiers]