Paquet : clustalw (2.1+lgpl-7) [debports]
Liens pour clustalw
Ressources Debian :
Télécharger le paquet source :
IntrouvableResponsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [www.clustal.org]
Paquets similaires :
alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
Ce programme réalise l'alignement de séquences multiples de nucléotides ou d'acides aminés. Il identifie le format des séquences en entrée et détermine s'il s'agit d'acides nucléiques (ADN/ARN) ou d'acides aminés (peptides). Le format en sortie peut être choisi parmi divers formats pour les alignements multiples, comme Phylip ou FASTA. Clustal W est largement reconnu.
Les données en sortie de Clustal W peuvent être modifiées manuellement ou avec un éditeur d'alignement comme Seaview ou le logiciel compagnon Clustal X. Lorsqu'un modèle est construit à partir des alignements, il peut être utilisé pour améliorer les recherches dans les bases de données. Celles-ci peuvent être créées sous forme de modèles de Markov (HMM) avec le paquet HMMER.
Autres paquets associés à clustalw
|
|
|
|
-
- dep: libc6.1 (>= 2.31)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
-
- dep: libunwind8
- bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
-
- sug: clustalx
- alignement multiple de séquences d'acides nucléiques et de protéines - interface graphique
-
- sug: seaview
- interface multiplateforme pour l’alignement de séquences et la phylogénie
-
- enh: bioperl-run
- scripts d'enveloppe BioPerl
-
- enh: emboss
- ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne
-
- enh: t-coffee
- alignement multiple de séquences
Télécharger clustalw
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
---|---|---|---|
ia64 (portage non officiel) | 344,9 ko | 1 516,0 ko | [liste des fichiers] |