Paquet : chromimpute (1.0.3+dfsg-5)

[ Paquet source : chromimpute  ]

attribution d’épigénome systématique à grande échelle

ChromImpute prend un compendium existant de données épigénomiques et s’en sert pour prédire des traces de signal pour des combinaisons de mark-sample non mappées expérimentalement ou pour créer une version potentiellement plus robuste de jeux de données ayant été mappés expérimentalement. ChromImpute base ses prédictions sur des fonctions de traces de signal d’autres marques ayant été mappées dans l’échantillon cible et la marque cible dans d’autres échantillons ayant ces fonctions combinées grâce à un ensemble d’arbres de régression.

Autres paquets associés à chromimpute

• dep: default-jre

  environnement d'exécution Java standard ou compatible

  ou java7-runtime

  paquet virtuel fourni par default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre, openjdk-19-jre, openjdk-20-jre, openjdk-21-jre, openjdk-22-jre, openjdk-23-jre, openjdk-8-jre

  ou java8-runtime

  paquet virtuel fourni par default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre, openjdk-19-jre, openjdk-20-jre, openjdk-21-jre, openjdk-22-jre, openjdk-23-jre, openjdk-8-jre

  ou java9-runtime

  paquet virtuel fourni par default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre, openjdk-19-jre, openjdk-20-jre, openjdk-21-jre, openjdk-22-jre, openjdk-23-jre

  ou java10-runtime

  paquet virtuel fourni par default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre, openjdk-19-jre, openjdk-20-jre, openjdk-21-jre, openjdk-22-jre, openjdk-23-jre

  ou java11-runtime

  paquet virtuel fourni par default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre, openjdk-19-jre, openjdk-20-jre, openjdk-21-jre, openjdk-22-jre, openjdk-23-jre

• dep: jarwrapper (>= 0.5)

  exécution d'exécutables Java au format jar

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	72,6 ko	88,0 ko	[liste des fichiers]