Paquet : cwltool (3.1.20241024121129-1)

[ Paquet source : cwltool  ]

implémentation de la référence du langage Common Workflow

C'est l'implémentation de référence des standards de Common Workflow Language.

Les standards ouverts CWL servent à décrire des analyses de flux de travail et des outils afin de les rendre portables et déployabls sur une grande diversité d'environnements logiciels et matériels, des stations de travail aux clustrs en passant par le cloud et le calcul haute performance (HPC). CWL a été conçu pour satisfaire les besoins des scientifiques manipulant beaucoup de données comme la bioinformatique, l'imagerie médicaale, l'astronomie, la physique et la chimie.

L'implémentation de la référence CWL (cwltool) vise à être entièrement personnalisée et à offrir une validation exhaustive de fichiers CWL, mais aussi d'autres outils de travail avec des descriptions CWL.

Étiquettes: Administration système: Automatisation et ordonnancement, Virtualisation, Domaine: field::astronomy, field::biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:molecular, Biologie structurale, field::medicine, field::physics, Mis en œuvre en: Python, Interface utilisateur: interface::commandline, role::program, Sciences: Calcul, Champ d'application: Utilitaire, Class of system: system::cloud, system::laptop, Serveur, Virtual, But: use::analysing, use::filtering, Format pris en charge: Étiquette supplémentaire nécessaire, Fonctionne avec: works-with::semantic-data, works-with::software:package

Autres paquets associés à cwltool

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-arcp

  (Archive and Package) URI parser and generator

• dep: python3-argcomplete

  complètement (Tab) de bash/zsh pour argparse – Python 3

• dep: python3-coloredlogs

  sortie colorée de terminal pour le module de connexion de Python 3

• dep: python3-cwl-utils (>= 0.32)

  Python Utilities and Autogenerated Classes for CWL v1.0 - v1.2

• dep: python3-mypy-extensions

  Experimental type system extensions for mypy typechecker (Python 3)

• dep: python3-prov

  W3C Provenance Data Model (Python 3)

• dep: python3-psutil

  module fournissant des fonctions pratiques pour la gestion de processus –⋅Python3

• dep: python3-pydot

  interface Python pour dot de Graphviz

• dep: python3-pyparsing

  alternative pour la création et l'exécution de grammaires simples –⋅Python⋅3.x

• dep: python3-rdflib (>> 6)

  Python 3 library containing an RDF triple store and RDF parsers/serializers

• dep: python3-requests

  bibliothèque HTTP simple et élégante pour Python3, construite pour les êtres humains

• dep: python3-ruamel.yaml

  Roundtrip YAML parser/emitter (Python 3 module)

• dep: python3-schema-salad (>= 8.4.20230808163024)

  Schema Annotations for Linked Avro Data (SALAD)

• dep: python3-setuptools

  Améliorations de Python3 Distutils

• dep: python3-spython

  Command line Python tool for working with Singularity

• rec: nodejs

  E/S par événement pour le moteur JavaScript V8

• sug: cwltool-doc

  Common Workflow Language reference implementation -- docs

• sug: podman

  tool to manage containers and pods

  ou docker.io

  environnement d’exécution de conteneurs Linux

  ou singularity-container

  plateforme de conteneur centré sur la prise en charge de « mobilité de calcul »

Télécharger cwltool

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	499,0 ko	5 894,0 ko	[liste des fichiers]